文化是人們的高級精神生活，它包含著思想和理論，以及生存方式和方法。文化就是“以文化之”，使其進入美好和諧的社會狀態。

明末清初的臺灣，文化教育遠遠落后于大陸。鄭成功入臺之前，荷蘭殖民者占據臺灣，西方傳教士在臺灣傳教，臺灣民眾多習荷語荷文。連橫《臺灣通史?教育志》載：“荷蘭得之……乃派牧師布教……永歷二年，各社始設小學，每學三十人，課以荷語荷文……”所以當時臺灣的少數民族“多習羅馬字，能作書，削鵝管，略尖斜，注墨于中，揮寫甚速，凡契券公文均用之”。但西方文化難以促進以山行水處地理環境為特點的臺灣生產力，鄭氏和清廷治理臺灣的相當一段時期內，臺灣少數民族地區仍然處于原始粗耕階段。如耕種不知使用牛耕梨耙，不知栽種五谷和收割方法，“或將堅木炙火為鑿，以代農器”。沒有歲時年月，只憑草木枯榮、聽鳥音判斷季節。 捕魚“用三叉鏢射之，或手網取之”。飲食“東西螺食豬肉，連毛燔燎, 肝則生食”。而“聲教所不及”，中國傳統儒家文化、朱子文化在島內遲緩傳播，臺灣社會生活處于無序的狀態，如衣著“男裸全體，女露上身”， 婚姻“不擇婚，不倩媒妁”，更有生番“黥面文身，若魔鬼，殺人為雄” 的惡習。凡此種種，說明臺灣少數民族過著原始社會生活。儒家文化和朱子文化在島內傳播，意識形態統一于中華傳統文化，既是鄭氏和清廷治理臺灣的要求，也是臺灣社會的客觀需要。

臺灣漢化教育肇基于鄭成功祖孫四代。鄭成功出身于海商之家，南安鄉學和南京太學的儒學教育，為其奠定了堅實的基礎。南明隆武二年（清順治三年，1646）正月，鄭成功又到朱子理學發祥地的閩北抗清，樹立起忠君愛國的思想。閩北抗清失敗后，他在金、廈經營海上貿易，以商養戰，同時以仁、義、禮、智、信、金、木、水、火、土命名陸師十武鎮，把儒家思想付諸實踐。更重要的是鄭成功有一支傳播儒學和朱子文化的中堅力量。南明永歷十五年（順治十八年，1661）,鄭成功收復臺灣，“士大夫之東渡者蓋八百余人”，知名的有沈光文、徐孚遠、王忠孝、張煌言、曹從龍、陳士京等, 其中沈光文、徐孚遠就是《臺灣三字經》中提到的“光文”和“徐君”。沈光文，字文開，別號期庵，浙江鄞縣人。明太仆少卿。他入臺后在目加溜灣 設教授學，“兼以醫藥濟人”，被稱為臺灣文教的肇始人，有“全郡風氣開自太仆”“海東文獻初祖”之說。目加溜灣因此成為全臺傳播漢學最早的地方。徐孚遠，字復齋，江蘇華亭人。明崇禎十五年（1642）進士。在臺灣“以忠義為做厲，延平聽之，娓娓竟夕。凡有大事，諮而后行”。此外，鄭成功還從“道南理窟”“理學名邦”之譽的閩北帶去不少官兵。據江日升 《臺灣外紀》和莊起儔《漳浦黃先生年譜》記載，黃道周隨隆武帝在閩北抗清時，在建溪流域的延平（今福建省南平市延平區）、建安（今福建省建甌市）、建陽（今福建省南平市建陽區）、崇安（今福建省武夷山市）和贛南等地區招兵數千或萬人，從政治生態分析，這些官兵的前途只能隨鄭氏東渡。

臺灣官方的漢化教育肇基于陳永華。鄭成功去世后，世子鄭經襲位。陳永華以“成湯”“文王”重視教育興邦為例，向鄭經提出“速建圣廟，立學校”的建議。鄭經起初認為臺灣荒服新創、地方狹小、人口不多，暫緩設學，但陳永華強調辦學的必要性。他比喻說，人若“使逸居無教，何異禽獸？須擇地建立圣廟，設學校以收人材。庶國有賢士，邦本自固，而世運日昌矣”。在陳永華的堅持下，次年春，建成圣廟，旁建明倫堂，鄭經親率文武官員首次舉行春祭大典，參與者上千人。臺南孔廟因此被稱為“全臺首學”。隨后，又令各社設立學校，延請大陸通儒教授弟子，規定一般八歲兒童都要入小學，教以經史文章。又命天興、萬年兩州及承天府立學。同年三月，設學院，以陳永華為主持，建太學，以葉亨為國子助教。全臺三年一試，州試有名者參加府試，府試有名者參加院試，院試錄取者入太學。“自此臺人始知學。”

鄭經去世后，陳永華輔佐鄭經長子鄭克???治理臺灣，鞏固辦學成果，臺灣漢化教育進一步得到發展。

學校是涵養化育之地，但涵養化育并非只限于學校，作為臺灣的管理者的言行和施政實踐同樣負有職責。鄭成功入臺后，在其施政的措施中積極實踐朱子思想，傳播朱子文化。如重視農業生產，入臺之初就把古代“寓兵于農”之法移植臺灣，開展大規模的墾荒。他說：“大凡治家治國，以食為先。”這種理念來自朱子“民生之本在食，足食之本在農”的重農思想。為了發展農業，鄭成功還給番社發放鐵梨、耙、鋤等農具和耕牛，又派漢族同胞到少數民族地區傳授耕作技術，這都體現了朱子的重農務本思想。鄭經襲位后，采納洪旭的建議，大力開展墾荒發展農業。在鄭氏的治理下，“臺灣日盛，田疇市肆不讓內地”。同時廣施德禮仁政，體恤番民。如鄭成功在鼓勵官兵招佃墾荒的同時，又作出不許紛爭、混圈土民和百姓現耕田地, 不許斧斤不時、竭澤而漁等多項規定，如有違反不僅要沒收田地，還要嚴懲。為防止漢番糾紛，又設立番界，保護少數民族的利益。此外，鄭成功還把儒學和朱子文化貫穿于常民生活日用之中，其中一個重要的舉措就是把儒家仁德思想融入地名。如地名中有仁德里、仁和里、依仁里、歸仁里、仁壽里、崇德里、善化里、感化里等，讓臺灣民眾人人皆知。

連橫《臺灣通史?關征志》中說：“自延平入臺以來，與民休息，而永華又咻噢之，道之以政，閑之以誼，教之以務，使之以和，漸之以忠，厲之以勇，勸之以利，嚴之以刑，民于是乎可任也。二十年間，臺灣……善乎德化之入人深也!”