南宋以后，許多書院根據講學需要，從事刻書。其經費來源主要靠政府撥給學田，支付官帑，所以書院刻書通常列入官刻范圍。建陽古書院處在刻書業繁盛的環境里，刻書具有優越的條件。南宋以后，有的書院刻書力量雄厚，產生了刻書專業化的傾向，不少刻本流傳于世，被稱為“書院本”。特別是康熙晚期福州鰲峰書院刊刻的大型叢書《正誼堂全書》，聞名于世。

建寧府境內書院刻書有兩個特點:一是范圍廣泛，經、史、子、集都有；二是多刻宋、明理學家著作。現擇要介紹于下。

建寧建安書院:宋嘉熙二年（1238）建寧知府王埜在府治重建書院，匾稱建安書院。先后刻書多種。知見有南宋初刊宋項安世《周易玩辭》16卷，宋嘉熙三年（1239）刊《晦庵先生文集》100卷，宋淳祐五年（1245）又刊《續集》10卷，并合并印行。宋咸淳元年（1265）由山長黃鏞主持，合刻《晦庵先生朱文公文集》100卷、續集11卷、別集10卷。入元后，續有刻書，如元至正九年（1349）刊趙君信《蜀漢本末》3卷等。

建陽考亭書院:考亭原為朱熹之父朱松卜居之所。宋紹熙元年（1190）朱熹自崇安徙居于此，更匾曰滄洲，晚年在此講學著述，對閩學發展影響極大。宋淳祐四年（1244）御賜“考亭書院”匾。元代以后多次重建修葺。由宋至清，多有刻書。知見有元大德間（1297-1307）刊《晦庵先生語錄類要》18卷。明萬歷十七年（1589）刊《考亭志》。清雍正七年（1729）刊宋朱松《韋齋集》，清雍正八年（1730）刊又道光二十年重刊《朱子文集大全類編》110卷，等等。

建寧屏山書院:宋代學者劉子翚（號屏山）棄官歸隱后于崇安創建書院，收徒講學。宋淳祐二年（1242）理宗賜名“屏山”，元初毀于兵火。后在建寧府另建同名書院。知見有元至正十二年（1360）刊宋陳傅良《止齋先生文集》26卷、附錄1卷、遺文1卷等。

建陽梅溪書院:刻書較多。知見有元大德十一年（1307）刊唐孫思邈《校正千金翼方》30卷，元泰定元年（1324）刊宋朱熹撰、滕洪輯《類編標注文公朱先生經濟文銜》前集25卷、合集25卷、續集22卷，元元統二年（1334）刊宋陰時夫輯《韻府群玉》20卷等。

建陽鰲峰書院:在建陽縣崇泰里熊墩，唐尚書熊秘建。知見有元至正十三年（1353）刊宋熊禾《勿軒易學啟蒙圖傳通義》7卷等，又明代刊有宋趙令時《侯鯖錄》8卷等。

建陽化龍書院:邑人劉應李建。知見有元刊宋劉《云莊劉文簡公文集》13卷等。

建陽云莊書院:宋代學者劉故居。宋嘉定三年（1210）改建為書院。宋嘉熙三年（1239）御賜“云莊書院”匾。南宋以后多有刻書。知見有元刊宋祝穆輯《新編古今事文類聚》前集、后集、續集、別集、新集、外集共221卷。明代有正統九年（1444）刊劉《云莊劉文簡公文集》12卷，嘉靖二十三年（1544）刊《古今說海》112卷等。清代有同治十三年（1874）重刊上引劉文集等。

建安椿莊書院:知見有元刊本陳元靚《纂圖增新群書類要事林廣記》42卷等。

崇安南山書院:南宋時朱熹門人蔡沈創建。知見有元至正二十六年（1366）刊宋陳彭年《廣韻》5卷、《大廣益會玉篇》30卷等。后者有日本慶長九年（1604）翻刻本。

詹氏建陽書院:知見有元大德年間（1297-1307）刊《新增決科古今源流至論》前集、續集、別集共30卷，元至正八年（1348）刊《千家注分類杜工部集》25卷等。

建陽同文書院:宋乾道年間（1165-1173）朱熹創建，后遭兵燹，元大德十一年重建。知見有明刊袁達《佩蘭文集》3卷等。