基督教在清光緒十六年（1890年）傳入建陽，當時有中華圣公會福建教區派出的英籍傳教士鹿崢嶸到建陽水東設點傳教。水東群眾極力反對，拆毀教堂。光緒二十二年（1896年）2月，鹿崢嶸再次來建陽，得到當政者支持，建陽縣基督教組織正式成立，在北門建天福堂（次年建成），并設醫館。宣統2年（1914年）在開福寺下（現為縣人民武裝部住地）建基督泛愛軒，為基督教會人員住所，聘請本地教師開辦淑德女校。民國初年，建陽基督教有所發展，在黃坑、長坪、麻沙、莒口、將口、徐墩街（今徐市鄉所在地）、后山建禮拜所，開展基督教會活動，在麻沙、徐市各辦一所學堂，在黃坑辦基督售書所，在泛愛軒內設基督閱報所。民國11年（1922年）在城內鐵進欄旁購舊房，建禮拜堂、牧師房，由王瑞安牧師主持，于次年10月落成。民國19年因經濟困難、醫診所、婦校、小學、閱報室均停辦。

基督教傳入水吉較遲。民國11年英籍女傳教士楊師姐和胡起鴻牧師到水吉傳教，創辦毓秀婦校，開辦診所，到14年才正式成立中華圣公會水吉救主堂。

抗日戰爭中期，浙贛和閩海戰事緊張，遷居建陽的基督教徒很多，建陽縣基督教會一度興旺，參加縣基督教徒禮拜的達千余人。抗日戰爭勝利后，外地基督教徒大都返回原籍，建陽縣基督教會活動轉入低潮，僅有建陽城區天福堂、水吉救主堂每周有一次主日活動。

建國前夕，由于活動經費的困難，鄉村的禮拜所幾乎完全停止活動。建國初期的1949年，建陽、水吉兩地的基督教恢復活動，訂立《愛國公約》1951年4月，建陽縣基督教三自（自治、自養、自傳）革新委員會成立。據1951年8月統計，全縣有基督教徒139人。1952年1月和1953年5月縣人民政府先后正式批準天福堂和救主堂恢復教會活動。此后，建陽基督教徒走“三自”道路，積極投身各項政治活動。

“文化大革命”10年，建陽基督教會受摧殘，牧師遭批斗，教堂被占用，基督教會活動完全停止。

中共十一屆三中全會后，宗教信仰的自由得到法律的保護，中國共產黨的宗教政策重新落實，基督教會房產共4000多平方米或回收，或予以賠償。1983年3月，建陽城區天福堂進行修復并恢復了活動。不久，水吉救主堂也恢復活動。建陽縣鄉間基督教會活動點還有徐市、麻沙、書坊、崇雒、將口、胡巷、黃坑、九峰、回龍、周家。1992年統計，全縣基督教徒1925人。