原籍德化縣赤水吉嶺，后遷居永春縣桃城(城關)民國27年(1938年)10月，建甌縣第六區改為水吉特別行政區署(相當于縣級政權機構)許清瑞即奉調任水吉特區第一任區長前兩個月，閩北大刀會會首林乃導率300余會徒洗劫并火燒水吉街，數百戶百姓無家可歸，滿目瘡痍，百廢待興。許清瑞一上任就著手計劃拓寬街面，將水吉街建成閩南街市風格的新街街道兩旁的店面前各有近兩米寬能蔭蔽雨水陽光的走廊，方便行人、顧客往來。他出面向富豪募集資金，聘用6個醫務人員，以三山(福州)會館為院址，創辦水吉衛生院。勒令禁吸鴉片，查封鴉片煙館二處，懲辦鴉片煙館老板。

他任水吉特區區長時，正值國共兩黨合作抗日剛達成協議之際。能體察民情，識大體，顧大局，逢會便宣傳抗戰戰績，褒揚抗日英雄壯舉，號召支援前方抗戰。民國28年他提出“好男要當兵”的響亮口號，三次發動青年報名從軍救國，有百余人參軍，投入抗戰。組織抗敵后援會、抗建(抗日建國)劇團，到城鄉廣泛宣傳抗日道理，發動群眾支援抗戰，教唱《義勇軍進行曲》等抗日歌曲，開展勸募活動。民國29年春，籌建水吉特區圖書館，配備6名專職人員，開展抗日宣傳。

民國29年10月，水吉建縣，許清瑞任縣長。有一次，他下鄉到回龍遇到廟會，他故意撞倒裝神弄鬼的神棍。“縣太爺不信邪”，時傳為佳話。國30日本侵略軍進逼浙贛線前方吃緊，軍用物資大增，通貨膨脹，嚴重影響國計民生。他為首組織水吉縣物資評價委員會，自任主任委員，親自按日審議物價行情，限制物價。同年，在水吉縣還發起“一元獻機運動”，如期完成捐錢買飛機支援抗戰的任務。

在反共的閩浙贛三省綏靖指揮部成立后，他派行動隊直接參與“清剿”政和與水吉邊境的紅軍游擊隊，屠殺革命干部、群眾，

他任職水吉期間重視體育工作，平整南浦溪邊的沙灘為縣運動場，發展體育運動，并于民國30年秋舉辦全縣體育運動大會。民國31年春，創辦水吉有史以來第一所初級中學。同年4月，清瑞調任建甌政府主任秘書。抗戰勝利后，赴臺任職，病逝于臺灣。